Leptospirosis in the Seychelles : geographic, molecular and epidemiological investigations of a zoonotic disease in a tropical insular environment

La leptospirose est une maladie negligee emergente touchant plus particulierement les regions tropicales, et plus encore les iles tropicales telles que les Seychelles, qui enregistrent des incidences humaines parmi les plus elevees au monde. Cette these a pour objectifs d’explorer l’eco epidemiologie de la leptospirose aux Seychelles (i) en utilisant les rats comme marqueurs d’exposition environnementale, (ii) en decrivant l’epidemiologie moleculaire de la maladie chez l’homme et l’animal a travers une approche “One Health”, et enfin (iii) en identifiant les comportements et professions a risque tout en en comparant la situation actuelle a celle decrite il y a 25 ans. La combinaison d’approches geographique, moleculaire et clinique vise a dresser un tableau complet de la situation epidemiologique de cette maladie aux Seychelles en integrant les reservoirs animaux, l’homme et l’environnement qu’ils occupent.La fragmentation de l’habitat et la proximite de ressources alimentaires apparaissent comme de bons predicteurs d’infection chez les rats. Les analyses geo-spatiales permettent de mettre en evidence d’autres variables correlees negativement (altitude ou distance a un point d’eau douce) ou positivement (niveau d’urbanisation, pluviometrie) au statut d’infection chez les rats. Ces resultats pourraient etre pris en compte dans les politiques d’amenagement du territoire mises en place dans des buts de conservation des habitats ou de controle des rongeurs, afin de reduire l’exposition de l’homme a des pathogenes maintenus dans l’environnement par les rats. Si le niveau d’urbanisation est positivement correle avec le statut d’infection, ce patron pourrait au moins en partie resulter de la distribution des deux especes Rattus norvegicus et Rattus rattus. En effet la premiere espece, retrouvee essentiellement en milieu urbain, est nettement plus infectee que la deuxieme que l’on retrouve partout sur l’ile. Neanmoins, la comparaison des leptospires retrouves chez les rats et chez les cas humains graves indique que les rats ne sont impliques que dans un tiers des transmissions a l’homme, la majorite des cas humains etant causee par des leptospires dont le(s) reservoir(s) reste(nt) a identifier. Une incidence annuelle de 54,6 (95% IC 40,7-71,8) pour 100 000 habitants confirme l’importance medicale majeure de cette maladie dans le pays. La maladie touche tres majoritairement les hommes (96%) et presente un taux de mortalite eleve (11,2%), essentiellement associe a des formes severes (dysfonctions renales et hepatiques, hemorragie pulmonaire). Les activites agricoles et le jardinage, la proximite d’elevages et de chats, une thrombocytopenie, une leucocytose, un taux de bilirubine eleve et des valeurs elevees aux tests de fonction renale sont de bons predicteurs de leptospirose. La distribution geographique des cas humains ne correspond pas a celle des districts hebergeant des populations de rats aux prevalences d’infection elevees, en coherence avec un role restreint des rats dans la leptospirose humaine.La comparaison des donnees presentees ici avec celles publiees il y a 25 ans revele un changement dans les comportements et les expositions, et montre qu’une meilleure prise en charge hospitaliere a vraisemblablement contribue a faire diminuer la mortalite liee a la leptospirose, meme si celle-ci reste elevee. Un faible niveau de connaissance de la maladie en population generale souligne l’importance de mettre en place des campagnes de sensibilisation. Les donnees produites dans le cadre de cette these stimulent la mise en place d’etudes complementaires visant a mettre en evidence le(s) reservoir(s) complementaire(s) et adapter les mesures de prevention pour limiter le fardeau que represente cette maladie aux Seychelles, aujourd’hui encore reconnue comme la maladie infectieuse causant le plus de deces dans le pays.