Effets de différents modes d’administration d’antibiotiques sur la déplétion du microbiote intestinal et sur la composition corporelle chez la souris

Introduction et but de l’etude Les modeles animaux presentant un microbiote intestinal « deplete » sont de plus en plus utilises pour caracteriser le role de ce microbiote dans diverses pathologies. En particulier, la depletion des bacteries du microbiote par administration d’antibiotiques represente une alternative peu onereuse et facile a mettre en place comparee a des modeles axeniques. De nombreux protocoles sont actuellement utilises dans la litterature, differant par la nature des antibiotiques utilises, la duree de traitement et le mode d’administration. Dans cette etude, nous avons compare l’efficacite de trois modes d’administration d’un cocktail d’antibiotiques sur la depletion des bacteries du microbiote chez la souris. Nous avons en parallele evalue l’impact potentiel de ces antibiotiques sur le poids et la composition corporelle. Materiel et methodes Un cocktail d’antibiotiques (ampicilline, neomycine, metronidazole, vancomycine), correspondant au cocktail le plus frequemment utilise dans la litterature, a ete administre quotidiennement a des souris C57Bl/6 mâles, âgees de 8 semaines, pendant 12 jours soit par gavage oral (1 a 2 fois/jour), soit par ajout dans l’eau de boisson des animaux. La depletion des bacteries du microbiote induite par ce cocktail a ete evaluee au cours du temps par cytometrie en flux et par PCR quantitative. La composition corporelle des animaux a ete suivie en parallele par RMN. Resultats et analyse statistique Nous avons observe, apres 12 jours de traitement, une efficacite variable de depletion des bacteries fecales en fonction du mode d’administration utilise. Dans tous les cas, cette diminution est associee a une augmentation du taux d’hydratation des feces et est majoritairement restauree deux semaines apres l’arret des antibiotiques. L’administration par un unique gavage oral quotidien montre une efficacite de depletion partielle, avec une hyperproliferation intestinale de certains taxa comme les gammaproteobacteries (et plus particulierement le genre Escherichia/Shigella ; amplification ×3,1 ± 1,2 × 103 apres 7 jours de traitement ; p  Conclusion Ces resultats constituent un ensemble de donnees utiles pour les experimentateurs souhaitant choisir le protocole de depletion le plus adapte pour evaluer le role du microbiote intestinal dans diverses situations physiopathologiques.