Caractérisation moléculaire et biodiversité de Mycobacterium tuberculosis dans la région Antilles-Guyane et analyse comparative à une région métropolitaine, l’Aquitaine

2003 
Resume La tuberculose est une maladie infectieuse et contagieuse en pleine recrudescence et dont la surveillance epidemiologique a ete renforcee par des techniques de biologie moleculaire. Dans ce contexte, nous nous sommes particulierement interesses aux cas de tuberculose de la region Antilles-Guyane sur une periode de deux ans (1997 et 1998) par l’analyse de leurs genotypes. Nos resultats ont ete confrontes a une region metropolitaine (l’Aquitaine) equivalente demographiquement avec des liens privilegies vis-a-vis de notre region et beneficiant d’un reseau de surveillance pour la tuberculose comparable au notre. Ainsi, nous avons employe la methode PCR appelee spoligotypage, utilisee en premiere intention afin d’optimiser la methode IS6110–RFLP appliquee depuis plusieurs annees mais demeurant contraignante. Ainsi 105 souches des Antilles-Guyane et 172 souches d’Aquitaine ont ete typees par spoligotypage et par la methode de reference IS6110–RFLP. Les resultats du premier groupage par spoligotypage ont fait l’objet d’une analyse comparative par les empreintes genomiques obtenues par IS6110–RFLP. Ainsi le taux de transmission recente a ete estime a 34,3 % dans la region Antilles-Guyane et a 10,5 % en Aquitaine lui conferant un degre de polymorphisme important. Grâce au differents profils obtenus par spoligotypage, nous avons pu etudier leur repartition dans les trois differentes regions et mettre en evidence des types qui leurs sont communs comme les types 53, 50 et 42, des types plus localises comme les types 33 et 14 retrouves respectivement en Aquitaine et aux Antilles ainsi que des types endemiques comme le 76 retrouve uniquement en Guyane. De ce fait, nous avons pu emettre des hypotheses quant a l’evolution des souches au cours du temps.
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