Molecular epidemiology of dengue in Jamaica: dengue virus genotypes in Jamaica, 2007

The genotypes of dengue viruses (DENV) isolated from patients with dengue in Jamaica during 2007 were determined using DNA sequencing and phylogenetic analysis of the C-prM gene junction. The 17 DENV analysed included strains of DENV serotypes 1 (DENV-1, n = 3), DENV-2 (n = 7) and DENV-4 (n = 7). All strains of DENV-1 were classified as genotype III, while 1 of 7 strains of DENV-2 belonged to the Asian American/Asian genotype, genotype I/ III (Jamaica genotype), 2 were genotype V, the American genotype and 4 strains clustered with reference strains belonging to genotype IV. The 6 DENV-4 strains from Jamaica and the control strain clustered together in a separate clade from Caribbean/ American reference strains, which belong to genotype II and Asian strains, classified as genotypes I and III. There has been little evolution in the DENV-1 strains circulating in Jamaica over the years and this might reduce the risk of outbreaks due to this serotype. In contrast, the high genetic diversity in strains of DENV-2 viruses in circulation, the presence of more recently introduced genotypes and a new clade of DENV-4 might contribute to the epidemic potential of these DENV serotypes. These preliminary data clearly indicate the need to maintain laboratory surveillance, and other control measures against hyperendemicity of dengue in Jamaica. Los genotipos de los virus del dengue (DENV) aislados de pacientes con dengue en Jamaica durante 2007, fueron determinados usando secuenciacion de ADN y analisis filogenetico de la union del gen C-prM . Los 17 DENV analizados incluyeron cepas de serotipos de DENV 1 (DENV-1, n = 3), DENV-2 (n = 7) y DENV-4 (n = 7). Todas las cepas de DENV-1 fueron clasificadas como genotipo III, mientras que 1 de 7 cepas de DENV-2 pertenecian al genotipo asiatico americano/asiatico, genotipo I/ III (genotipo de Jamaica), 2 fueron genotipo V, el genotipo americano y 4 cepas agrupadas con cepas de referencia pertenecientes al genotipo IV. Las 6 cepas DENV-4 de Jamaica y la cepa de control se agruparon en un clado aparte de cepas de referencia caribena/americana, que pertenecen al genotipo II, y las cepas asiaticas, clasificadas como genotipos I y III. Ha habido poca evolucion en las cepas DENV-1 que han estado circulando en Jamaica a traves de todos estos anos, y esto podria reducir el riesgo de brotes a causa de este serotipo. En contraste con ello, la alta diversidad genetica de las cepas de los virus DENV-2 en circulacion, la presencia de mas genotipos introducidos recientemente, y un nuevo clado de DENV-4 podrian contribuir al potencial epidemico de estos serotipos de DENV. Estos datos preliminares indican claramente la necesidad de mantener la vigilancia de laboratorio, y otras medidas de control contra el caracter hyperendemico del dengue en Jamaica.