Séquençage complet de l’exome dans les néphropathies indéterminées des jeunes adultes : séquençage d’abord et rétrophénotypage ensuite ?

Introduction Les examens de genetique ne sont souvent prescrits que dans des cas particuliers en nephrologie adulte. En France, les tests genetiques habituellement realises sont des panels de genes, soit le sequencage d’un nombre reduit de genes ciblant au mieux le phenotype du patient. Depuis un an, nous avons mis en place une approche sans a priori, par sequencage de l’exome (Whole Exome Sequencing, WES) chez les jeunes adultes avec une nephropathie d’origine indeterminee. Methodes Nous avons evalue le rendement diagnostique du WES dans notre population et les repercutions cliniques des diagnostiques effectues. Dans notre service, depuis 2018, tous les patients avec une nephropathie indeterminee debutant avant l’âge de 45 ans ont la possibilite d’etre sequences si leurs parents acceptent d’etre preleves (« exome trio ») afin de pouvoir etudier la segregation d’un possible variant pathogene. En l’absence d’apparente disponible, la possibilite d’un examen genetique (« exome solo ») n’est offerte qu’en cas de forte suspicion de nephropathie d’origine genetique (consanguinite, antecedent familial de nephropathie). Les patients atteints d’une polykystose dominante etaient exclus de l’etude. Resultats obtenus ou attendus Le rendement diagnostique du WES est de 28 % dans cette population ( Tableau 1 ). Les principaux diagnostics genetiques etaient des nephronophtises, des basolopathies et des polykystoses recessives. Ces resultats etaient le plus souvent inattendus, avec des phenotypes cliniques relativement pauvres. Dans tous les cas, le diagnostic genetique a eu des consequences cliniques : nouvelle perspective clinique, conseil genetique familial et aide pour la selection des donneurs en cas de don vivant apparente. Conclusion Du fait de leur phenotype souvent atypique et pauvre, nous meconnaissons probablement un grand nombre de nephropathies d’origine genetique chez l’adulte. Avec un important rendement diagnostique, des consequences cliniques et therapeutiques majeures et un cout mesure (∼2000 €), l’acces au sequencage de l’exome dans les nephropathies indeterminees des jeunes adultes devrait etre developpe.