Optimisation du diagnostic des infections à entérovirus et étude de leur pouvoir pathogène

2018 
Les enterovirus humains (EV) representent la premiere cause des meningites aseptiques chez l'enfant. Le diagnostic de certitude repose sur la detection genomique de l'enterovirus par RT-PCR dans des echantillons de liquide cephalorachidien (LCR) est recommandee pour le diagnostic. La fievre sans point d'appel et les maladies de type "sepsis" sont egalement des affections frequentes chez les nourrissons (0 a 2 ans), qui peuvent etre la consequence d'une infection virale, en particulier a EV. Actuellement, le diagnostic des EV dans le sang est rarement etabli dans la pratique courante.Les donnees concernant 1) l’existence d’une replication de l’EV dans les leucocytes sanguins, 2) le niveau de charge virale de l’EV dans le sang et les echantillons de LCR et sa correlation eventuelle avec l’intensite du processus inflammatoire reactionnel sont fragmentaires. Dans la premiere partie de cette these, l'objectif etait d'evaluer la detection des EV par PCR dans des echantillons de sang de nouveau-nes, de nourrissons et d'enfants hospitalises pour une fievre isolee, un sepsis ou un syndrome meninge. Nous avons mene une etude observationnelle prospective multicentrique nationale (etude BLEDI) dans 35 departements de pediatrie au cours de la periode estivo-automnale (augmentation des circulations d'EV) en 2015-2016. Nos resultats ont montre que le taux de detection des EV dans le sang etait significativement plus eleve que dans le LCR chez les nouveaux-nes et les nourrissons hospitalises pour une fievre isolee, un sepsis ou un syndrome meninge.Ces donnees ouvrent des perspectives pour un nouvel algorithme de diagnostic des fievres inexpliquees chez les enfants âges de moins de 2 ans. Dans le second volet de cette these, nous avons etudie de maniere prospective la charge virale d'EV dans le sang et dans des echantillons de LCR de patients infectes. Nos resultats ont montre que la charge virale d'EV dans le sang variait selon le groupe d'âge, la presentation clinique et le type d'EV. Trois profils de cinetique d'infection comparant la charge virale dans le sang et le LCR ont ete envisages et sont en cours d'etude. Enfin, le dernier axe etait de determiner s'il existait une replication de l’EV dans les leucocytes sanguins. Nous avons montre a partir d'echantillons de sang infectes in vitro par EV que la replication de ces virus variait selon les genotypes d'EV.
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