Détection de la mutation T790 M par PCR digitale dans une population de cancers bronchiques non à petites cellules (CBNPC) mutés EGFR, avant le traitement par ITK-EGFR : résultats d’une étude ancillaire à l’étude IFCT Biomarqueurs – France

Introduction La presence d’une mutation T790 M du gene EGFR est retrouvee dans pres de 50 % des cas de resistance acquise aux ITK- EGFR . Des etudes anterieures realisees sur de petits effectifs suggerent que la mutation T790 M peut etre detectee avant la mise sous traitement. Nous utilisons dans cette etude une technique ultra-sensible et quantitative qui est la PCR digitale pour analyser la frequence et les correlations cliniques de la detection au diagnostic de la mutation T790 M dans une grande cohorte de patients porteurs d’un CBNPC avec mutation de l’ EGFR . Methodes Nous avons analyse 256 patients mutes EGFR de la cohorte IFCT Biomarqueurs France pour lesquels de l’ADN etait encore disponible en quantite suffisante et traites par ITK- EGFR . La PCR digitale etait effectuee sur un systeme QX200 (Bio-Rad ® , Hercules, Etats-Unis). Tous les echantillons ont ete testes en double. Une cohorte d’ADN de cancers colorectaux a servi de controle negatif. Resultats La PCR digitale a permis la mise en evidence d’une mutation T790 M pre-therapeutique chez 23/256 (9 %) patients. L’abondance fractionnelle (AF) de la mutation T790 M etait > 10 %, > 1 %,  0,1 %,  0,03 %, EGFR . Les populations avec et sans mutation T790 M ne presentaient pas de donnees cliniques differentes. Dans le modele de Cox, la mutation T790 M est de mauvais pronostic en survie globale pour les patients dont la tumeur a une AF entre 1–10 % (HR 2,64, IC95 % : 1,06–6,6, p  = 0,04) et > 10 % (HR 15,43, IC95 % : 5–47, p n  = 9/20, 45 %) et classique (2–24 mois) ( n  = 8/20, 40 %) que chez les patients a progression lente (> 24 mois) ( n  = 3/20, 15 %) ( p  = 0,02). Dans les cas de progression rapide, l’AF de la mutation T790 M etait de plus de 1 % chez 7/9 (77 %) patients. Conclusion La detection par PCR digitale de la mutation T790 M pre-therapeutique est rapportee chez 9 % des patients CBNPC mutes EGFR et a une valeur de mauvais pronostic, surtout quand l’AF est superieure a 10 %.