Etude de la circulation environnementale du virus de l'hépatite E entre l'Homme et l'environnement par caractérisation moléculaire de souches humaines et environnementales

Le virus de l’hepatite E (VHE) est responsable d’hepatites chez l’Homme. Bien que l’infection par le VHE soit le plus souvent aigue, des formes chroniques ont ete decrites chez des sujets immunodeprimes. Quatre genotypes majeurs sont decrits. Les genotypes 1 et 2 circulent dans les pays en voie de developpement ou ils n’infectent que l’Homme avec une transmission hydrique. Les genotypes 3 et 4 circulent plutot dans les pays developpes, ou ils peuvent infecter l’Homme mais aussi des animaux (cochons, sangliers et cerfs), se transmettent a l’Homme par l’ingestion de viande crue ou mal cuite d’un animal infecte. Cependant les voies de transmission du VHE dans les pays developpes ne sont pas encore claires et une voie de contamination hydrique est suspectee. L’objectif de ce travail etait de clarifier la circulation du VHE dans le nord-est de la France (exemple de pays developpe). Nous avons etudie des prelevements humains, de sangliers, de cochons de ferme, ainsi que des effluents d’un abattoir porcin, des eaux d’entree d’une station d’epuration (STEP) et des moules d’eau douce utilisees pour concentrer des virus eventuellement presents dans des rivieres. Le VHE de genotype 3 a ete retrouve dans des prelevements humains, de sangliers, d’effluents d’abattoir et de STEP. Plusieurs substitutions d’acide amine ont ete mises en evidence. Certaines sont de possibles signatures d’origine du prelevement. Quelques-unes entrainent des modifications d’antigenicite et d’hydrophobie predites, pouvant avoir des consequences sur le comportement du virus et sa circulation. Enfin, les prelevements de STEP comportaient un melange de variants d’origines diverses, en faveur d’un role de l’eau dans la circulation du VHE. Des tests fonctionnels doivent etre effectues afin de mesurer l’impact des substitutions observees.