Analysis of the p53/CEP-1 regulated non-coding transcriptome in C. elegans by an NSR-seq strategy

在最近的年里，大量非编码的 RNA (ncRNAs ) 在 C 被识别了。elegans 但是他们的功能仍然不好被学习。在 C。elegans， CEP-1 是基因的 p53 家庭的唯一的相当或相同的事物。为了获得 ncRNAs 的抄写侧面，在正常、紫外的强调条件下面由 CEP-1 调整了，我们把 not-so-random hexamers priming 策略用于在 C 定序的 RNA。elegans，这 NSR-seq 策略高效地弄空从样品的 rRNA 抄本和显示出的高技术的 replicability。我们识别了其明显的表示被 CEP-1 镇压的超过 1,000 ncRNAs，当约 200 被激活时。在 40% CEP-1 附近，激活的 ncRNAs 倡导者包含一个通常认为的 CEP-1-binding 地点。调整 ncRNAs 经常是的 CEP-1 聚类并且专注于 X 染色体。这些结果显示众多的 ncRNAs 涉及 CEP-1 transcriptional 网络并且这些特别在 C 在 X 染色体上被充实。elegans。