Diagnostic rapide des méningites et encéphalites infectieuses par PCR multiplex : bilan dans un groupement hospitalier général

Introduction Dans le diagnostic des meningites et encephalites (M/E) infectieuses, l’analyse microbiologique du liquide cerebrospinal (LCS) a une sensibilite variable selon le germe et un delai d’au moins 24 heures. Grâce une bonne sensibilite (> 85 %) l’analyse par biologie moleculaire (BM) peut reduire ce delai, les durees de sejour et les consommations d’anti-infectieux. Nous avons compare la performance d’un panel de BM et celle de la microbiologie conventionnelle (MC) dans l’etude des LCS pour le diagnostic de M/E infectieuses. Materiels et methodes Cette etude prospective bicentrique dans un groupement hospitalier (GH) general a inclus entre fevrier 2017 et janvier 2018 les patients âges de plus de 18 ans avec suspicion clinique de ME et leucorachie de plus de 5 leucocytes/mm 3  et/ou proteinorachie superieure a 0,4 g/L. Les LCS ont ete etudies en MC (examen direct et culture) et en BM avec le panel FilmArray ME (Biomerieux). Resultats Trente patients âges de 20 a 96 ans ont ete inclus, dont 7 hospitalises en reanimation (23 %) et 23 en medecine (77 %). Sept (23 %) avaient un facteur d’immunodepression (2 traites par anti-TNF et 5 infectes par le VIH). Les signes cliniques principaux etaient : fievre (90 %, n  = 27), signes d’encephalite (47 %, n  = 14), syndrome meninge (43 %, n  = 13). Il y avait une hyperleucorachie dans 18 cas (60 %) dont 5 (28 %) a predominance neutrophilique et 11 (61 %) lymphocytaire et une hyperproteinorachie dans 26 cas (86 %). Des anti-infectieux a dose meningee avaient ete debutes dans 16 cas (53 %). Une analyse par BM a ete realisee chez 2 patients sans meningite ni hyperproteinorachie mais avec immunodepression severe (CD4 +   Haemophilus influenzae dont l’analyse en MC etait negative. Un cas de meningite a Streptococcus salivarius , negatif en MC et en BM, a ete diagnostique par detection de l’ARN 16S du LCS. Apres analyse par BM, 12 adaptations therapeutiques ont ete faites des j1. Conclusion Dans cette etude, malgre un effectif limite, l’analyse du LCS par BM a permis un diagnostic et une adaptation therapeutique precoces, sans necessite d’externaliser les PCR virales. Ce panel apparait tres utile en complement de la MC pour les GH sans BM locale. Son utilisation doit faire l’objet d’une discussion pluridisciplinaire (infectiologue, biologiste) pour une interpretation opitmale des resultats. Une etude sur un large effectif avec une analyse medico-economique et de l’interet chez des populations cibles (immunodepression severe, pediatrie) serait utile.