Protein-protein docking based on shape complementarity and Voronoi fingerprint

La prediction de la structure tri-dimensionnelle des complexes proteine-proteine est un enjeu majeur pour la bioinformatique. Nous avions montre dans des travaux precedents que grâce a la modelisation par un diagramme de Voronoi de la structure des proteines, et a l'utilisation d'algorithmes genetiques, il etait possible d'optimiser des fonctions de score permettant de distinguer avec une bonne fiabilite les conformations natives des conformations non-natives. Nous montrons dans cet article que cette approche peut etre sensiblement amelioree en combinant celle-ci avec des modeles en corps rigide generes par l'algorithme de docking Hex. Cette nouvelle approche, testee sur les cibles CAPRI des rounds 8 a 18, permet de classer dans les 10 meilleures, une conformation quasi-native pour 7 cibles sur les 9 disponibles.