Analyse génétique de patients consanguins Marocains atteints de la maladie de Parkinson combinant puce à ADN et panel de gènes

Introduction Jusqu’a present, 14 genes ont ete signales comme etant responsables de la forme monogenique de la maladie de Parkinson (MP), representant une frequence mondiale de 5 a 10 %. Parmi eux, 10 genes ont ete associes a la forme autosomique recessive. Objectifs Determiner le profile genetique d’une cohorte de patients consanguins d’origine Marocaine atteints de MP par la combinaison des technologies des puces a ADN et de panel de genes en sequencage nouvel generation (NGS). Methodes L’ADN de 18 patients, nes d’un mariage consanguin (14 cas isoles et 4 cas familiaux), a ete examine pour des rearrangements d’exon dans le gene PRKN en utilisant la puce Cytoscan HD (Affymetrix). Celui des patients n’ayant pas de rearrangements a ete analyse par sequencage Sanger des genes candidats au niveau des regions d’homozygotie (ROH) ou par NGS par l’utilisation d’un panel contenant 22 genes associes a la MP. Resultats Nous avons trouve des deletions d’exons du gene PRKN homozygotes chez 2 patients et heterozygotes composites chez 1 patient. Deux autres patients ont montre une ROH du locus 1p36.12 et presentent des mutations ponctuelles homozygotes Q456X et L539F du gene PINK1 . L’analyse des 13 patients restant par panel NGS a montre une mutation homozygote W258X du gene ATP13A2  chez 2 patients et une mutation a l’etat heterozygote affectant le cadre de lecture dans SYNJ1 chez un patient avec un debut tardif (76 ans). Discussion L’analyse clinique a montre que les patients ayant la mutation ATP13A2 developpaient une MP debutante avec un phenotype severe, alors que les patients ayant des mutations PRKN ou PINK1 presentaient une MP a debut precoce avec un phenotype relativement benin. Conclusion En identifiant des mutations pathogenes dans 45 % (8/18) de notre serie MP, nous montrons que la combinaison de l’analyse par biopuces chromosomiques et du NGS est une approche puissante pour identifier les bases genetiques de la forme recessive de MP. Informations complementaires Ce travail a ete finance par le Centre national de recherche scientifique et technique du Ministere de l’enseignement superieur, de la recherche scientifique et de la formation des cadres du Maroc.