牦牛 HYOU1 基因克隆及组织表达分析

为探究 HYOU1 基因在牦牛中的组织表达谱，通过对西藏牦牛 HYOU1 基因的CDS区进行克隆测序，分析该基因的结构和功能，采用RT-PCR技术检测黄牛和牦牛肺脏、心脏、肝脏、乳腺、大脑及肌肉中 HYOU1 基因的相对表达量。结果表明：（1） HYOU1 基因CDS区长度为3 006 bp，其中A、G、C和T含量分别为25.0%、31.1%、26.7%和17.1%，存在一定碱基偏好性；发现1个（ACG→ACA）SNP位点，为同义突变。（2）生物信息学分析表明该蛋白呈中性，为较不稳定、亲水性分泌信号蛋白；存在一个跨膜螺旋（TMhelix）区位于13-35氨基酸位置；二、三级蛋白结构分析发现其主要的空间构象为：无规则卷曲及α-螺旋。（3）聚类分析显示，西藏牦牛与野牦牛的遗传距离最近，与瘤牛及普通牛的遗传距离次之，与水牛最远。（4）RT-PCR结果显示 HYOU1 基因在黄牛和牦牛肝脏、乳腺、肺脏、大脑、心脏、肌肉6个组织中均有表达，且相对表达量依次递减；在相同组织中，黄牛组织的表达量均显著高于牦牛组织中的表达量（ P < 0.05），其中黄牛肝脏组织的表达量为牦牛表达量的4.4倍。